截至2018年底，北碚区共拥有卫生机构371家。其中，医院24家，卫生院11家，门诊部9家，疾病预防控制中心1家，妇幼保健院1家，卫生监督所1家，社区卫生服务中心12家，村卫生室106家，个体诊所201家。卫生机构床位5243张，比上年增长5.6%，其中医院床位4272张，卫生院床位512张。拥有卫生机构人员6783人，比上年增长6.5%，其中执业医师和执业助理医师2232人，注册护士2432人。
